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RNA-binding protein siPOOL library(RNAi)

更新時(shí)間:2024-08-07

訪問量:726

廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家

生產(chǎn)地址:德國(guó)

簡(jiǎn)要描述:
siRNA pools(即siPOOLs)是一款經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計(jì)的高復(fù)雜性的包含30條siRNA的混合物,經(jīng)證明可有效消除脫靶效應(yīng),提高了結(jié)果的可靠性(Hannus et al., 2014)。
RNA-binding protein siPOOL library(RNAi)
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RNA-binding protein siPOOL library(RNAi)



siRNA pools(即siPOOLs是一款經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計(jì)的高復(fù)雜性的包含30siRNA的混合物,經(jīng)證明可有效消除脫靶效應(yīng),提高了結(jié)果的可靠性(Hannus et al., 2014)。Pack Hunter (pooling) 方法通過將當(dāng)個(gè)siRNA的濃度稀釋到刺激表型的閾值以下來對(duì)抗單個(gè)siRNA的脫靶。借助專有的設(shè)計(jì)算法,siPOOLs中的siRNA序列經(jīng)過優(yōu)化,以實(shí)現(xiàn)較大的轉(zhuǎn)錄本覆蓋率,高效雜交,且將旁系同源基因進(jìn)行了過濾,從而實(shí)現(xiàn)高效和特異性的基因沉默。


siPOOLs產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

  1. 使用簡(jiǎn)單快捷  siPOOLs與多種轉(zhuǎn)染試劑兼容,幾天內(nèi)就能看到結(jié)果。

  2. 高度特異性且有效  siPOOLs在標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系中將脫靶率降低5-25倍,且在1-3 nM下實(shí)現(xiàn)基因敲低率≥70%。

  3. 一致的表型  與siRNA相比,由siPOOL產(chǎn)生的表型高度一致。

  4. 確保經(jīng)過檢驗(yàn)  采用RT-qPCR對(duì)siPOOL干擾效果進(jìn)行驗(yàn)證,如果在最佳轉(zhuǎn)染條件下,敲低率低于70%,則有可能重新設(shè)計(jì)。

  5. 使用專業(yè)的數(shù)據(jù)庫注釋進(jìn)行定制設(shè)計(jì)  專業(yè)的設(shè)計(jì),確保優(yōu)化熱力學(xué)特性,且避免旁系同源基因的干擾。

  6. HPLC純化且無毒  所有siPOOL均經(jīng)過HPLC純化,可降低污染物和副作用的風(fēng)險(xiǎn)。


為了確保siPOOLs針對(duì)當(dāng)前注釋的基因,設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)會(huì)根據(jù)新版的RefSeq注釋不斷更新siPOOL的設(shè)計(jì)。
siPOOL庫(siRNAs庫):庫中的每個(gè)基因,都被30個(gè)池化的siRNA靶向。

產(chǎn)品名稱

物種

規(guī)格

貨號(hào)

E3連接酶siPOOL庫
E3 Ligase siPOOL library

human

1 nmol

si-L010-000E3L

激酶siPOOL庫
Kinase siPOOL library

human

1 nmol

si-L010-000505

RNA結(jié)合蛋白siPOOL庫
RNA-binding protein siPOOL library

human

1 nmol

si-L010-000RBP

GPCR siPOOL庫
GPCR siPOOL library

human

1 nmol

si-L010-00GPCR

泛素化酶 siPOOL庫
Ubiquitinase siPOOL library

mouse

1 nmol

si-L010-000UBI

注:如需了解其他規(guī)格的的產(chǎn)品信息,請(qǐng)聯(lián)系我們。
更多規(guī)格,例如:0.1nmol、0.25nmol、0.5nmol等。
通常,siPOOLs采用帶條形編碼的離心管。不過,也可根據(jù)客戶需求定制96孔板或384孔板布局的siPOOLs產(chǎn)品。

運(yùn)輸和保存

siPOOL庫,以懸液的形式保存,常溫(RT)下運(yùn)輸。如果有特別要求,siPOOL也可以干粉形式運(yùn)輸。siPOOL庫可以穩(wěn)定地在RT下運(yùn)輸至少4周。

到達(dá)后,siPOOL庫應(yīng)存儲(chǔ)在-20°C至-80°C。在這樣的條件下,siPOOL庫至少穩(wěn)定兩年。

如果siPOOL庫以干粉形式運(yùn)輸,siPOOL應(yīng)在無RNase的水中重懸。

在客戶收到貨物(或重懸)后,我們建議您將siPOOLs分裝成小體積,存儲(chǔ)在-20°C到-80°C條件。為了達(dá)到最佳效果,盡量減少反復(fù)凍融的次數(shù)。在良好的儲(chǔ)存條件以及規(guī)范的操作處理下,siPOOLs可穩(wěn)定保存至少2年。


對(duì)于靶向基因沉默,RNA干擾(RNAi)具有易于操作、快速結(jié)果、高效率、廣泛適用于各種細(xì)胞類型的多重優(yōu) 勢(shì)。其具有瞬轉(zhuǎn)效應(yīng)和劑量依賴效應(yīng),這點(diǎn)與小分子非常相似。然而,目前的siRNA試劑其特異性和基因沉默效率可變,阻礙了它們作為藥物發(fā)現(xiàn)和基因研究工具的應(yīng)用。

siTOOLs Biotech由Michael Hannus博士和Gunter Meister教授于2013年9月成立,由德國(guó)雷根斯堡大學(xué) 和Intana Bioscience制藥服務(wù)公司聯(lián)合運(yùn)營(yíng)。目前推出有3個(gè)產(chǎn)品系列:(1)siPOOLs:一種siRNA混合物,有 效增加基因沉默特異性,“稀釋"傳統(tǒng)RNA干擾試劑的脫靶效應(yīng)。(2)raPOOLs:一種穩(wěn)健的RNA親和純化方 案,適用于基因功能和相互作用的生物化學(xué)研究。(3)riboPOOLs:適合任意物種的核糖體RNA去除試劑,高效且經(jīng)濟(jì)。


關(guān)于RNA-binding protein siPOOL library(RNAi)以及siRNA pools(siPOOLs)的更多信息,歡迎聯(lián)系我們!


引用文獻(xiàn):

Hannus M. et. al.: siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049-61(2014)
Marine S. et. al.: Common Seed Analysis to Identify Off-Target Effects in siRNA Screens. Journal of Biomolecular Screening 1-9 (2011)
Jackson A. et. al.: Expression Profiling reveals off-target gene regulation by RNAi. Nature Biotechnology (2003)

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