介紹酵母雙雜交的兩種構(gòu)建方法
更新時(shí)間:2021-07-27 點(diǎn)擊次數(shù):2322次
酵母雙雜交技術(shù)作為研究蛋白質(zhì)相互作用的主要方法,在規(guī)?;鞍踪|(zhì)相互作用研究中占據(jù)舉足輕重的地位,已經(jīng)成為分子生物學(xué)研究領(lǐng)域的重要實(shí)驗(yàn)手段,因此有不少生物公司提供從構(gòu)建雜交文庫到文庫篩選的一站式酵母雙雜交服務(wù)。但是酵母雙雜交技術(shù)的分子生物學(xué)操作是比較復(fù)雜的,包含從基因的載體構(gòu)建、蛋白質(zhì)的自激活檢測到多次酵母轉(zhuǎn)化和相互作用的確認(rèn),對酵母雙雜交技術(shù)進(jìn)行改進(jìn),可以提高其工作效率。
目前市場上提供的酵母雙雜交服務(wù)有核體系和膜體系兩種,酵母雙雜交與其他相互作用篩選手段相比,最大的優(yōu)勢在于它能夠適應(yīng)基因組水平的高通量篩選。美迪西提供酵母雙雜交服務(wù),其具有獨(dú)立優(yōu)質(zhì)的實(shí)驗(yàn)室和專業(yè)的實(shí)驗(yàn)人員,提供詳細(xì)的酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)步驟、原始數(shù)據(jù)和圖片、結(jié)果分析,可以出具檢測數(shù)據(jù)報(bào)告。
為了降低工作量使其更適用于高通量篩選,需要對酵母雙雜交技術(shù)進(jìn)行改進(jìn),常采用的手段有酵母雙雜交陣列篩選技術(shù)和規(guī)模化載體構(gòu)建方法。
1、酵母雙雜交陣列篩選技術(shù)
從傳統(tǒng)的酵母雙雜交技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展而來的酵母雙雜交文庫篩選技術(shù)能夠支持一個(gè)誘餌與整個(gè)cDNA文庫的篩選,可以用于篩選一個(gè)蛋白質(zhì)與整個(gè)cDNA文庫中的相互作用。但是該技術(shù)并不適用于基因組水平的相互作用篩選。
首先,基因組水平的相互作用篩選需要成千上萬的誘餌,而對這些誘餌進(jìn)行文庫篩選工作量極大;其次,由于cDNA片段不同,篩選過程中呈劣勢生長的菌株不容易得到篩選;最后篩庫同樣面臨單次篩選只能獲得文庫中極少部分的相互作用結(jié)果。為了適應(yīng)基因組水平的相互作用篩選,人們開發(fā)了酵母雙雜交陣列篩選技術(shù)。
陣列篩選法又可分為一對一陣列、高通量陣列法、亞庫對亞庫法。一對一陣列法含有不同BD-X的菌株和所有含不同AD-Y的菌株一一對應(yīng)篩選。
高通量陣列法是把所有不同ORF-AD集合成庫,然后與排成陣列的不同BD-X作用的篩選方法,其實(shí)質(zhì)是誘餌數(shù)量較大情況下的陣列化文庫篩選。亞庫對亞庫法把總數(shù)較大的DBD-X和AD-Y的成員分別編號并分組,每組含一定數(shù)量的成員,然后集合每組成員形成亞庫(pool),再用獵物亞庫對誘餌亞庫一一作用,篩選陽性克隆。此法工作量大,獲得的陽性克隆的獵物和誘餌都需測序鑒定。
2、規(guī)?;d體構(gòu)建方法
規(guī)模化酵母雙雜交篩選需要構(gòu)建大量的表達(dá)載體,因此載體構(gòu)建工作的質(zhì)量和速度對于后續(xù)的酵母雙雜交篩選至關(guān)重要。傳統(tǒng)的構(gòu)建載體的方法是限制酶切-連接方法,可以有效地將目的片段插入載體,然而其操作時(shí)間長,需要酶切、連接兩步反應(yīng),構(gòu)建成功后的重組質(zhì)粒需要進(jìn)行DNA測序來驗(yàn)證其正確性,表達(dá)載體的構(gòu)建過程中存在載體自連、連接困難等缺點(diǎn),這些缺點(diǎn)使得限制酶切-連接方法不能用于高通量的載體構(gòu)建。