DAP-seq在DELLA參與GA和JA信號(hào)通路的靶向調(diào)控的應(yīng)用
更新時(shí)間：2022-11-08 點(diǎn)擊次數(shù)：942次
2022年8月20日，廣西大學(xué)亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和廣西甘蔗生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的最新研究成果，在學(xué)術(shù)期刊Journal of Experimental Botany上發(fā)表，文章題目為 “ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling"。該期刊的影響因子為7.298。該研究使用DAP-seq技術(shù)鑒定了甘蔗ScAIL1轉(zhuǎn)錄因子靶向ScGAI啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合基序，進(jìn)一步研究表明，ScAIL1通過(guò)靶向DELLA調(diào)控JA合成和GA失活來(lái)平衡植物生長(zhǎng)和防御反應(yīng)。
現(xiàn)代甘蔗是一種復(fù)雜的多倍體植物。DELLA是GA信號(hào)通路的抑制因子，通過(guò)與多種植物激素協(xié)同來(lái)調(diào)節(jié)植物的生長(zhǎng)發(fā)育和防御反應(yīng)。甘蔗ScGAI編碼一種調(diào)節(jié)莖稈發(fā)育的DELLA蛋白。甘蔗DELLA蛋白由位于chr1B和chr1C上ScGAI基因的兩個(gè)等位基因編碼。然而，ScGAI等位基因的啟動(dòng)子是否相同，以及哪些轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)與ScGAI啟動(dòng)子結(jié)合介導(dǎo)ScGAI的轉(zhuǎn)錄尚不清楚。
該研究通過(guò)序列分析發(fā)現(xiàn)ScGAI等位基因在不同染色體上的轉(zhuǎn)錄受不同啟動(dòng)子序列的調(diào)控，基序分析和GUS活性測(cè)定進(jìn)一步證明不同的啟動(dòng)子序列，其結(jié)合基序和轉(zhuǎn)錄活性也不同。隨后，采用酵母單雜交技術(shù)篩選到25個(gè)與ScGAI啟動(dòng)子結(jié)合的潛在轉(zhuǎn)錄因子，并鎖定ScAIL1結(jié)合蛋白。ScAIL1是一個(gè)核定位的AP2家族轉(zhuǎn)錄因子。然后，酵母雜交、凝膠遷移率檢測(cè)、DAP-seq分析結(jié)果表明ScAIL1通過(guò)直接與ScGAI的兩個(gè)啟動(dòng)子結(jié)合來(lái)調(diào)控ScGAI的轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)染甘蔗原生質(zhì)體的實(shí)驗(yàn)表明ScAIL1抑制了ScGAI的轉(zhuǎn)錄，這與雙熒光素酶活性測(cè)定結(jié)果一致。進(jìn)一步通過(guò)BiFC，Co-IP和GST Pull Down實(shí)驗(yàn)證明ScAIL1能夠與自身相互作用，因此ScAIL1可能是以二聚體的形式參與ScGAI轉(zhuǎn)錄過(guò)程的抑制。多種脅迫處理下，ScAIL1表達(dá)上調(diào)、GA信號(hào)增強(qiáng)、JA信號(hào)下降，這表明了ScAIL1調(diào)控ScGAI轉(zhuǎn)錄的潛在功能可能與植物的防御反應(yīng)有關(guān)。為更好地了解ScAIL1參與植物防御反應(yīng)的分子機(jī)制，研究人員構(gòu)建了過(guò)表達(dá)ScAIL1的水稻。ScAIL1的過(guò)表達(dá)顯著提高了水稻對(duì)細(xì)菌枯萎病和水稻瘟病的抵抗力，同時(shí)阻礙了生長(zhǎng)和發(fā)育。此外，在過(guò)表達(dá)ScAIL1的水稻中，與應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的基因顯著上調(diào)。內(nèi)源性植物激素含量和基因表達(dá)分析進(jìn)一步表明，ScAIL1過(guò)表達(dá)增強(qiáng)了水稻對(duì)細(xì)菌枯萎病和水稻瘟病的抵抗力，而不是促進(jìn)生長(zhǎng)，并且這種反應(yīng)與JA合成和GA失活作用有關(guān)。這些結(jié)果為證明ScAIL1在植物防御反應(yīng)中的作用與JA和GA信號(hào)傳導(dǎo)有關(guān)提供了分子證據(jù)。
圖1. ScAIL1定位于細(xì)胞核，并且直接靶向ScGAI啟動(dòng)子，圖1F為DAP-seq分析鑒定的2個(gè)結(jié)合基序
圖2. ScAIL1調(diào)控JA合成和GA失活來(lái)平衡植物生長(zhǎng)和防御反應(yīng)的分子機(jī)制模式圖
綜上所述，該研究表明了甘蔗ScGAI的轉(zhuǎn)錄受兩個(gè)不同的啟動(dòng)子調(diào)控，而ScGAI的轉(zhuǎn)錄被AP2家族轉(zhuǎn)錄因子ScAIL1抑制。ScAIL1是植物防御反應(yīng)的正調(diào)控因子，ScAIL1通過(guò)負(fù)調(diào)控DELLA、增加JA合成和誘導(dǎo)GA失活來(lái)介導(dǎo)植物的防御反應(yīng)。該研究揭示了ScAIL1通過(guò)調(diào)控GA和JA信號(hào)通路參與植物防御反應(yīng)的新機(jī)制，也為復(fù)雜多倍體作物的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究提供了一個(gè)新視角。
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